Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX1Q92499 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX1Q92499 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX1Q92499 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX1Q92499 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX1Q92499 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX1Q92499 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX1Q92499 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDX1Q92499 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms