Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SELENOMQ8WWX9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SELENOMQ8WWX9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SELENOMQ8WWX9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms