Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP2Q8WWK9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CKAP2Q8WWK9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms