Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC4Q8WW27 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APOBEC4Q8WW27 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC4Q8WW27 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms