Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
WHAMMQ8TF30 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WHAMMQ8TF30 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WHAMMQ8TF30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WHAMMQ8TF30 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WHAMMQ8TF30 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WHAMMQ8TF30 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WHAMMQ8TF30 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WHAMMQ8TF30 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms