Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3IL1Q8TBN0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3IL1Q8TBN0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms