Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LINC00301Q8NCQ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LINC00301Q8NCQ3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LINC00301Q8NCQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms