Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf29Q8N999 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf29Q8N999 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C12orf29Q8N999 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms