Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP3Q8IZU3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SYCP3Q8IZU3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCP3Q8IZU3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1293.5 ms