Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM73Q86UV7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM73Q86UV7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM73Q86UV7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms