Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LDB1Q86U70 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LDB1Q86U70 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms