Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSSK4Q6SA08 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSSK4Q6SA08 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSSK4Q6SA08 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms