Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01545Q5VT33 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LINC01545Q5VT33 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms