Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD3Q5T2D3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OTUD3Q5T2D3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD3Q5T2D3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms