Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PAN3Q58A45 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms