Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KRTAP21-1Q3LI58 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms