Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NECTIN1Q15223 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NECTIN1Q15223 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NECTIN1Q15223 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
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