Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PTCH1Q13635 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
PTCH1Q13635 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
PTCH1Q13635 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PTCH1Q13635 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
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