Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL1Q13616 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUL1Q13616 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUL1Q13616 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUL1Q13616 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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