Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3FQ13275 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEMA3FQ13275 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3FQ13275 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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