Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSNK2A1P68400 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CSNK2A1P68400 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CSNK2A1P68400 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms