Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPS13P62277 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS13P62277 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS13P62277 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS13P62277 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS13P62277 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS13P62277 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS13P62277 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPS13P62277 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS13P62277 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS13P62277 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS13P62277 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS13P62277 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS13P62277 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPS13P62277 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS13P62277 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS13P62277 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS13P62277 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS13P62277 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS13P62277 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS13P62277 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPS13P62277 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS13P62277 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS13P62277 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS13P62277 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPS13P62277 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS13P62277 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPS13P62277 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPS13P62277 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS13P62277 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS13P62277 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS13P62277 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS13P62277 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS13P62277 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS13P62277 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS13P62277 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS13P62277 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS13P62277 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPS13P62277 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS13P62277 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS13P62277 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS13P62277 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS13P62277 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS13P62277 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS13P62277 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS13P62277 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS13P62277 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS13P62277 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms