Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18A1P54219 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC18A1P54219 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms