Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSFMP43897 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSFMP43897 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSFMP43897 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSFMP43897 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSFMP43897 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSFMP43897 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSFMP43897 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSFMP43897 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSFMP43897 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSFMP43897 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSFMP43897 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSFMP43897 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSFMP43897 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSFMP43897 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSFMP43897 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSFMP43897 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSFMP43897 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSFMP43897 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSFMP43897 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSFMP43897 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSFMP43897 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSFMP43897 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSFMP43897 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSFMP43897 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSFMP43897 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSFMP43897 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSFMP43897 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSFMP43897 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSFMP43897 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSFMP43897 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSFMP43897 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSFMP43897 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSFMP43897 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSFMP43897 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSFMP43897 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSFMP43897 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSFMP43897 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSFMP43897 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSFMP43897 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSFMP43897 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSFMP43897 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSFMP43897 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSFMP43897 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSFMP43897 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSFMP43897 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSFMP43897 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TSFMP43897 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TSFMP43897 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSFMP43897 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TSFMP43897 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms