Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHI3L1P36222 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHI3L1P36222 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHI3L1P36222 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms