Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ABCD1P33897 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABCD1P33897 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCD1P33897 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCD1P33897 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms