Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD34P28906 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD34P28906 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CD34P28906 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD34P28906 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CD34P28906 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD34P28906 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD34P28906 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD34P28906 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD34P28906 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD34P28906 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD34P28906 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD34P28906 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD34P28906 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD34P28906 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD34P28906 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD34P28906 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD34P28906 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD34P28906 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD34P28906 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD34P28906 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD34P28906 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD34P28906 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD34P28906 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD34P28906 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD34P28906 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD34P28906 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD34P28906 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD34P28906 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD34P28906 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD34P28906 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD34P28906 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD34P28906 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CD34P28906 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD34P28906 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CD34P28906 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CD34P28906 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CD34P28906 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms