Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA4P22748 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA4P22748 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CA4P22748 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CA4P22748 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA4P22748 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA4P22748 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA4P22748 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CA4P22748 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA4P22748 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA4P22748 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA4P22748 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CA4P22748 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CA4P22748 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CA4P22748 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CA4P22748 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CA4P22748 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CA4P22748 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CA4P22748 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CA4P22748 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CA4P22748 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CA4P22748 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CA4P22748 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CA4P22748 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CA4P22748 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CA4P22748 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CA4P22748 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CA4P22748 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CA4P22748 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CA4P22748 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CA4P22748 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CA4P22748 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CA4P22748 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CA4P22748 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CA4P22748 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CA4P22748 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CA4P22748 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CA4P22748 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CA4P22748 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CA4P22748 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CA4P22748 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms