Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN1P18031 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms