Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCP1P17987 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCP1P17987 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCP1P17987 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCP1P17987 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCP1P17987 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCP1P17987 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCP1P17987 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCP1P17987 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCP1P17987 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCP1P17987 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCP1P17987 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCP1P17987 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCP1P17987 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCP1P17987 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCP1P17987 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCP1P17987 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCP1P17987 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCP1P17987 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCP1P17987 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCP1P17987 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCP1P17987 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCP1P17987 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCP1P17987 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCP1P17987 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCP1P17987 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCP1P17987 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCP1P17987 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCP1P17987 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCP1P17987 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCP1P17987 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCP1P17987 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCP1P17987 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCP1P17987 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCP1P17987 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCP1P17987 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCP1P17987 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCP1P17987 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCP1P17987 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCP1P17987 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCP1P17987 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCP1P17987 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCP1P17987 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCP1P17987 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCP1P17987 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCP1P17987 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCP1P17987 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCP1P17987 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCP1P17987 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCP1P17987 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCP1P17987 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCP1P17987 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCP1P17987 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCP1P17987 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCP1P17987 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCP1P17987 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCP1P17987 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCP1P17987 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCP1P17987 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCP1P17987 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCP1P17987 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCP1P17987 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCP1P17987 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms