Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CREB1P16220 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB1P16220 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB1P16220 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB1P16220 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB1P16220 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB1P16220 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CREB1P16220 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB1P16220 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB1P16220 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB1P16220 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB1P16220 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB1P16220 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB1P16220 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CREB1P16220 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB1P16220 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB1P16220 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CREB1P16220 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CREB1P16220 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CREB1P16220 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB1P16220 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB1P16220 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB1P16220 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CREB1P16220 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CREB1P16220 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CREB1P16220 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB1P16220 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB1P16220 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB1P16220 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CREB1P16220 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CREB1P16220 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB1P16220 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB1P16220 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB1P16220 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB1P16220 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CREB1P16220 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB1P16220 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB1P16220 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB1P16220 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB1P16220 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB1P16220 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB1P16220 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB1P16220 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CREB1P16220 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CREB1P16220 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms