Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL4P12829 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL4P12829 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL4P12829 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL4P12829 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYL4P12829 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYL4P12829 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL4P12829 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL4P12829 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL4P12829 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL4P12829 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYL4P12829 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL4P12829 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL4P12829 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL4P12829 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYL4P12829 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL4P12829 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL4P12829 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL4P12829 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL4P12829 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYL4P12829 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL4P12829 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL4P12829 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL4P12829 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL4P12829 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL4P12829 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL4P12829 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYL4P12829 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL4P12829 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL4P12829 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL4P12829 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL4P12829 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL4P12829 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL4P12829 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYL4P12829 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL4P12829 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL4P12829 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL4P12829 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL4P12829 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL4P12829 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL4P12829 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYL4P12829 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL4P12829 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL4P12829 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL4P12829 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL4P12829 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL4P12829 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL4P12829 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL4P12829 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYL4P12829 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL4P12829 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL4P12829 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL4P12829 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL4P12829 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL4P12829 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MYL4P12829 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL4P12829 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL4P12829 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL4P12829 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL4P12829 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL4P12829 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYL4P12829 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYL4P12829 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYL4P12829 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL4P12829 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL4P12829 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL4P12829 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL4P12829 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYL4P12829 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL4P12829 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL4P12829 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL4P12829 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL4P12829 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYL4P12829 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYL4P12829 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms