Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHGAP10645 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHGAP10645 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHGAP10645 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHGAP10645 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHGAP10645 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHGAP10645 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHGAP10645 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHGAP10645 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHGAP10645 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHGAP10645 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHGAP10645 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHGAP10645 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHGAP10645 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHGAP10645 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHGAP10645 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHGAP10645 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHGAP10645 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHGAP10645 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHGAP10645 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHGAP10645 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHGAP10645 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGAP10645 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGAP10645 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGAP10645 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGAP10645 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGAP10645 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGAP10645 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHGAP10645 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHGAP10645 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHGAP10645 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHGAP10645 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHGAP10645 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CHGAP10645 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHGAP10645 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CHGAP10645 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHGAP10645 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHGAP10645 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHGAP10645 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CHGAP10645 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CHGAP10645 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHGAP10645 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHGAP10645 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHGAP10645 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CHGAP10645 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHGAP10645 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHGAP10645 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHGAP10645 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CHGAP10645 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHGAP10645 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHGAP10645 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHGAP10645 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CHGAP10645 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHGAP10645 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHGAP10645 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHGAP10645 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHGAP10645 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHGAP10645 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CHGAP10645 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CHGAP10645 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHGAP10645 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHGAP10645 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CHGAP10645 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHGAP10645 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHGAP10645 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHGAP10645 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHGAP10645 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms