Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF1P09603 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF1P09603 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF1P09603 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF1P09603 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF1P09603 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSF1P09603 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSF1P09603 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSF1P09603 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSF1P09603 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF1P09603 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF1P09603 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF1P09603 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF1P09603 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF1P09603 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSF1P09603 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF1P09603 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF1P09603 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF1P09603 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF1P09603 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF1P09603 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSF1P09603 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSF1P09603 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF1P09603 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF1P09603 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF1P09603 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF1P09603 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF1P09603 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSF1P09603 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSF1P09603 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSF1P09603 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF1P09603 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF1P09603 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF1P09603 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF1P09603 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF1P09603 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSF1P09603 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF1P09603 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF1P09603 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF1P09603 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF1P09603 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF1P09603 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSF1P09603 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF1P09603 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF1P09603 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF1P09603 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF1P09603 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF1P09603 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSF1P09603 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSF1P09603 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms