Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFPP02771 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AFPP02771 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
AFPP02771 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFPP02771 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFPP02771 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFPP02771 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AFPP02771 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFPP02771 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFPP02771 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFPP02771 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFPP02771 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AFPP02771 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFPP02771 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFPP02771 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFPP02771 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFPP02771 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFPP02771 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AFPP02771 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFPP02771 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFPP02771 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFPP02771 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFPP02771 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFPP02771 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AFPP02771 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFPP02771 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFPP02771 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFPP02771 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFPP02771 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFPP02771 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFPP02771 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFPP02771 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFPP02771 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFPP02771 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFPP02771 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFPP02771 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFPP02771 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFPP02771 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFPP02771 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFPP02771 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFPP02771 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFPP02771 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFPP02771 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFPP02771 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFPP02771 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFPP02771 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFPP02771 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AFPP02771 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AFPP02771 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFPP02771 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFPP02771 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFPP02771 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFPP02771 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFPP02771 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFPP02771 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFPP02771 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AFPP02771 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AFPP02771 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFPP02771 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFPP02771 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFPP02771 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFPP02771 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFPP02771 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFPP02771 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AFPP02771 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFPP02771 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFPP02771 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFPP02771 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFPP02771 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AFPP02771 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFPP02771 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFPP02771 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AFPP02771 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms