Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
ABCC9O60706 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC47.88■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.87■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC47.86■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC47.86■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC47.84■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC47.84■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.83■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC47.83■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC47.82■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC47.82■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
ABCC9O60706 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC47.8■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC47.79■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC47.76■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
ABCC9O60706 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC47.73■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC47.72■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.7■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
ABCC9O60706 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC47.69■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC47.69■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.68■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC47.66■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.22
ABCC9O60706 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC47.62■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC47.62■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
ABCC9O60706 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms