Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEMFO60524 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NEMFO60524 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEMFO60524 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEMFO60524 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEMFO60524 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEMFO60524 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NEMFO60524 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEMFO60524 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEMFO60524 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEMFO60524 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEMFO60524 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEMFO60524 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEMFO60524 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEMFO60524 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NEMFO60524 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEMFO60524 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEMFO60524 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEMFO60524 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEMFO60524 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEMFO60524 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEMFO60524 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEMFO60524 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEMFO60524 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEMFO60524 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEMFO60524 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEMFO60524 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEMFO60524 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEMFO60524 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEMFO60524 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEMFO60524 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEMFO60524 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEMFO60524 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NEMFO60524 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMFO60524 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMFO60524 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMFO60524 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMFO60524 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEMFO60524 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMFO60524 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMFO60524 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMFO60524 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMFO60524 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMFO60524 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMFO60524 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEMFO60524 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEMFO60524 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEMFO60524 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEMFO60524 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEMFO60524 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEMFO60524 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NEMFO60524 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms