Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN4O14493 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN4O14493 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN4O14493 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms