Protein–RNA interactions for Protein: O00327

ARNTL, Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARNTLO00327 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARNTLO00327 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARNTLO00327 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARNTLO00327 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARNTLO00327 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARNTLO00327 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARNTLO00327 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARNTLO00327 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms