Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3KR12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3KR12 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3KR12 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3KR12 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3KR12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
J3KR12 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KR12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KR12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KR12 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KR12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KR12 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
J3KR12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
J3KR12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
J3KR12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
J3KR12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
J3KR12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
J3KR12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3KR12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3KR12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3KR12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
J3KR12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
J3KR12 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
J3KR12 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KR12 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KR12 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KR12 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KR12 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
J3KR12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
J3KR12 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
J3KR12 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
J3KR12 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
J3KR12 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KR12 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KR12 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KR12 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KR12 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KR12 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
J3KR12 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3KR12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
J3KR12 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3KR12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3KR12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3KR12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
J3KR12 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KR12 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KR12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KR12 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KR12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KR12 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
J3KR12 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3KR12 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3KR12 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
J3KR12 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3KR12 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3KR12 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
J3KR12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3KR12 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
J3KR12 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3KR12 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3KR12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3KR12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
J3KR12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
J3KR12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
J3KR12 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
J3KR12 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3KR12 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3KR12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3KR12 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
J3KR12 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3KR12 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3KR12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
J3KR12 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3KR12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
J3KR12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3KR12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
J3KR12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms