Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STMND1H3BQB6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STMND1H3BQB6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STMND1H3BQB6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms