Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E9PQ18 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PQ18 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PQ18 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PQ18 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PQ18 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E9PQ18 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E9PQ18 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E9PQ18 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E9PQ18 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PQ18 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PQ18 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
E9PQ18 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PQ18 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PQ18 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PQ18 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E9PQ18 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
E9PQ18 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PQ18 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PQ18 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PQ18 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PQ18 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PQ18 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
E9PQ18 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E9PQ18 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E9PQ18 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E9PQ18 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E9PQ18 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E9PQ18 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.6 ms