Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB5A8MRT5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NPIPB5A8MRT5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPIPB5A8MRT5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPIPB5A8MRT5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NPIPB5A8MRT5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms