Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRIQ3A6PVS8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRIQ3A6PVS8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRIQ3A6PVS8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms