Protein–RNA interactions for Protein: A6NEV1

PRR23A, Proline-rich protein 23A, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23AA6NEV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRR23AA6NEV1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRR23AA6NEV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRR23AA6NEV1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms