Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT87PA6NCN2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT87PA6NCN2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT87PA6NCN2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms