Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR30

DDX21, Nucleolar RNA helicase 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX21Q9NR30 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 AC015845.2-202ENST00000580960 505 ntTSL 215.03■□□□□ -03e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 AC093496.1-201ENST00000525575 613 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.323e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.343e-8■■■■■ 62.1
DDX21Q9NR30 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 512.26□□□□□ -0.456e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 55.78□□□□□ -1.486e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 54.45□□□□□ -1.76e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 54.11□□□□□ -1.756e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.126e-18■■■■■ 61.7
DDX21Q9NR30 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 323.36■■□□□ 1.339e-8■■■■■ 58.5
DDX21Q9NR30 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.019e-8■■■■■ 58.5
DDX21Q9NR30 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.289e-8■■■■■ 58.5
DDX21Q9NR30 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)14.77□□□□□ -0.059e-8■■■■■ 58.5
DDX21Q9NR30 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-215ENST00000631193 991 ntTSL 520.83■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-203ENST00000460750 4738 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-210ENST00000490363 4065 ntTSL 515.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 RORC-202ENST00000356728 3050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 RORC-204ENST00000638901 2326 ntTSL 212.95□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 55.9
DDX21Q9NR30 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.291e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.671e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 220.83■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 TECTA-202ENST00000392793 7426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 AC012560.1-202ENST00000421324 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 POM121L2-201ENST00000429945 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 35.09□□□□□ -1.591e-6■■■■■ 49.7
DDX21Q9NR30 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 46.8
DDX21Q9NR30 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 46.1
DDX21Q9NR30 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)23.85■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 46.1
DDX21Q9NR30 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.162e-6■■■■■ 46.1
DDX21Q9NR30 DENND3-205ENST00000518198 1848 ntTSL 231.54■■■□□ 2.647e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-219ENST00000523058 906 ntTSL 331.18■■■□□ 2.587e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-215ENST00000520986 899 ntTSL 230.8■■■□□ 2.527e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.257e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.067e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.047e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.167e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.947e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-210ENST00000519291 560 ntTSL 420.19■□□□□ 0.827e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.717e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.697e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.587e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 TBXAS1-207ENST00000438104 752 ntTSL 516.44■□□□□ 0.227e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-208ENST00000518668 5185 ntTSL 516.27■□□□□ 0.197e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.187e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.117e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-214ENST00000602580 560 ntTSL 514.85□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-220ENST00000635845 1588 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.119e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-201ENST00000400178 700 ntTSL 314.22□□□□□ -0.137e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MTRNR2L4-201ENST00000399974 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 U3.46-201ENST00000365612 216 ntBASIC13.51□□□□□ -0.257e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.327e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 ACRBP-207ENST00000542357 838 ntTSL 512.4□□□□□ -0.427e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 PTPRD-207ENST00000463477 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.447e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.479e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 U3.18-201ENST00000390880 216 ntBASIC10.23□□□□□ -0.777e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.89e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-209ENST00000456342 648 ntTSL 210.01□□□□□ -0.817e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 29.98□□□□□ -0.819e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59.69□□□□□ -0.869e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.987e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -17e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-218ENST00000602935 554 ntTSL 58.74□□□□□ -1.017e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.189e-11■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 CACHD1-204ENST00000495994 5547 ntTSL 1 (best)7.5□□□□□ -1.217e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 CACHD1-202ENST00000470527 5260 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.467e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.577e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SMAD1-203ENST00000502342 262 ntTSL 32.96□□□□□ -1.947e-6■■■■■ 43.5
DDX21Q9NR30 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)26.77■■□□□ 1.886e-9■■■■■ 42.6
DDX21Q9NR30 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.356e-9■■■■■ 42.6
DDX21Q9NR30 CTNNA3-204ENST00000494580 470 ntTSL 36.52□□□□□ -1.373e-8■■■■■ 41.5
DDX21Q9NR30 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 41.5
DDX21Q9NR30 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 41.4
DDX21Q9NR30 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 41.4
DDX21Q9NR30 SORCS2-204ENST00000511199 532 ntTSL 411.36□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 41.4
DDX21Q9NR30 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.085e-7■■■■■ 41.3
DDX21Q9NR30 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.985e-7■■■■■ 41.3
DDX21Q9NR30 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 527.26■■□□□ 1.955e-7■■■■■ 41.3
DDX21Q9NR30 STXBP3-202ENST00000469338 294 ntTSL 223.07■■□□□ 1.285e-44■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.286e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 STXBP3-204ENST00000483586 561 ntTSL 221.7■■□□□ 1.065e-44■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.935e-44■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 CDHR5-207ENST00000531177 2816 ntTSL 218.96■□□□□ 0.636e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.26e-10■■■■■ 40.4
DDX21Q9NR30 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.016e-10■■■■■ 40.4
Retrieved 100 of 1,140 protein–RNA pairs in 347.1 ms