Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKN3Q6P5Z2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PKN3Q6P5Z2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PKN3Q6P5Z2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PKN3Q6P5Z2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PKN3Q6P5Z2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKN3Q6P5Z2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PKN3Q6P5Z2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PKN3Q6P5Z2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKN3Q6P5Z2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKN3Q6P5Z2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PKN3Q6P5Z2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKN3Q6P5Z2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKN3Q6P5Z2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKN3Q6P5Z2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKN3Q6P5Z2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKN3Q6P5Z2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKN3Q6P5Z2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKN3Q6P5Z2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKN3Q6P5Z2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKN3Q6P5Z2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKN3Q6P5Z2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKN3Q6P5Z2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKN3Q6P5Z2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKN3Q6P5Z2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKN3Q6P5Z2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PKN3Q6P5Z2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PKN3Q6P5Z2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PKN3Q6P5Z2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PKN3Q6P5Z2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PKN3Q6P5Z2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN3Q6P5Z2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN3Q6P5Z2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PKN3Q6P5Z2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PKN3Q6P5Z2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PKN3Q6P5Z2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PKN3Q6P5Z2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PKN3Q6P5Z2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PKN3Q6P5Z2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN3Q6P5Z2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN3Q6P5Z2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PKN3Q6P5Z2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PKN3Q6P5Z2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PKN3Q6P5Z2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PKN3Q6P5Z2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PKN3Q6P5Z2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PKN3Q6P5Z2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PKN3Q6P5Z2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PKN3Q6P5Z2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PKN3Q6P5Z2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PKN3Q6P5Z2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PKN3Q6P5Z2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PKN3Q6P5Z2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKN3Q6P5Z2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PKN3Q6P5Z2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PKN3Q6P5Z2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PKN3Q6P5Z2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PKN3Q6P5Z2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKN3Q6P5Z2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PKN3Q6P5Z2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKN3Q6P5Z2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PKN3Q6P5Z2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PKN3Q6P5Z2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PKN3Q6P5Z2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PKN3Q6P5Z2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PKN3Q6P5Z2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN3Q6P5Z2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PKN3Q6P5Z2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PKN3Q6P5Z2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PKN3Q6P5Z2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PKN3Q6P5Z2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PKN3Q6P5Z2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PKN3Q6P5Z2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PKN3Q6P5Z2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PKN3Q6P5Z2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PKN3Q6P5Z2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PKN3Q6P5Z2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKN3Q6P5Z2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PKN3Q6P5Z2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PKN3Q6P5Z2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PKN3Q6P5Z2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PKN3Q6P5Z2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PKN3Q6P5Z2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKN3Q6P5Z2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PKN3Q6P5Z2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKN3Q6P5Z2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKN3Q6P5Z2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PKN3Q6P5Z2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKN3Q6P5Z2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKN3Q6P5Z2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKN3Q6P5Z2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PKN3Q6P5Z2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms