Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 ELL3-205ENST00000486851 667 ntTSL 29.53□□□□□ -0.888e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 ATG16L1-209ENST00000431917 589 ntTSL 56.72□□□□□ -1.338e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 SNHG5-205ENST00000427501 680 ntTSL 23.87□□□□□ -1.798e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.88□□□□□ -2.278e-14■■■■■ 94.2
EFTUD2Q15029 RPLP0-222ENST00000551336 406 ntTSL 318.49■□□□□ 0.558e-18■■■■■ 93.9
EFTUD2Q15029 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.154e-18■■■■■ 92.8
EFTUD2Q15029 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 04e-18■■■■■ 92.8
EFTUD2Q15029 CCP110-211ENST00000573412 673 ntTSL 313.17□□□□□ -0.34e-18■■■■■ 92.8
EFTUD2Q15029 CCP110-210ENST00000569190 2600 ntTSL 212.77□□□□□ -0.364e-18■■■■■ 92.8
EFTUD2Q15029 CCP110-205ENST00000562083 595 ntTSL 311.55□□□□□ -0.564e-18■■■■■ 92.8
EFTUD2Q15029 CCP110-207ENST00000565376 698 ntTSL 310.3□□□□□ -0.764e-18■■■■■ 92.8
EFTUD2Q15029 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 311.17□□□□□ -0.621e-16■■■■■ 92.6
EFTUD2Q15029 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 214.81□□□□□ -0.043e-14■■■■■ 92.3
EFTUD2Q15029 ALDOA-215ENST00000565355 538 ntTSL 514.79□□□□□ -0.046e-26■■■■■ 92.2
EFTUD2Q15029 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.92e-6■■■■■ 91.6
EFTUD2Q15029 MTG2-205ENST00000466933 667 ntTSL 312.28□□□□□ -0.441e-13■■■■■ 91.5
EFTUD2Q15029 KAT5-214ENST00000534104 576 ntTSL 418.18■□□□□ 0.51e-17■■■■■ 91.4
EFTUD2Q15029 KAT5-217ENST00000534681 583 ntTSL 215.64■□□□□ 0.091e-17■■■■■ 91.4
EFTUD2Q15029 KAT5-210ENST00000531880 845 ntTSL 314.77□□□□□ -0.051e-17■■■■■ 91.4
EFTUD2Q15029 KAT5-206ENST00000527544 745 ntTSL 213.14□□□□□ -0.311e-17■■■■■ 91.4
EFTUD2Q15029 KAT5-207ENST00000528198 609 ntTSL 412.76□□□□□ -0.371e-17■■■■■ 91.4
EFTUD2Q15029 KAT5-215ENST00000534293 559 ntTSL 311.56□□□□□ -0.561e-17■■■■■ 91.4
EFTUD2Q15029 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.444e-14■■■■■ 89.7
EFTUD2Q15029 VIM-202ENST00000421459 753 ntTSL 27.45□□□□□ -1.226e-12■■■■■ 89.3
EFTUD2Q15029 VIM-207ENST00000495528 962 ntTSL 26.02□□□□□ -1.456e-12■■■■■ 89.3
EFTUD2Q15029 VIM-210ENST00000637053 508 ntTSL 23.18□□□□□ -1.96e-12■■■■■ 89.3
EFTUD2Q15029 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.315e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-211ENST00000578954 756 ntTSL 316.1■□□□□ 0.175e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-226ENST00000585241 774 ntTSL 516.1■□□□□ 0.175e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-216ENST00000580751 547 ntTSL 415.22■□□□□ 0.035e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-215ENST00000580642 545 ntTSL 415.22■□□□□ 0.035e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-206ENST00000577572 510 ntTSL 415.22■□□□□ 0.035e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 DFFA-203ENST00000476658 744 ntTSL 314.47□□□□□ -0.095e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.125e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-212ENST00000579061 646 ntTSL 314.04□□□□□ -0.165e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.25e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-12■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.331e-12■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-204ENST00000539244 977 ntTSL 1 (best)12.58□□□□□ -0.45e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-222ENST00000582792 531 ntTSL 512.52□□□□□ -0.415e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-202ENST00000269138 1548 ntTSL 212.47□□□□□ -0.415e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.51e-12■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-219ENST00000581570 571 ntTSL 511.7□□□□□ -0.545e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-225ENST00000585121 1545 ntTSL 211.65□□□□□ -0.555e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.611e-12■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-12■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 EZR-204ENST00000476189 956 ntTSL 310.8□□□□□ -0.685e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-213ENST00000579640 1840 ntTSL 210.68□□□□□ -0.75e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.721e-12■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-203ENST00000415083 3414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.735e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.741e-12■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.785e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-207ENST00000577636 580 ntTSL 310.15□□□□□ -0.785e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-210ENST00000578700 575 ntTSL 510.15□□□□□ -0.785e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 SS18-221ENST00000582448 585 ntTSL 510.15□□□□□ -0.785e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 29.64□□□□□ -0.871e-12■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC7.18□□□□□ -1.264e-13■■■■■ 88.9
EFTUD2Q15029 KHSRP-211ENST00000599642 428 ntTSL 218.3■□□□□ 0.526e-19■■■■■ 88.4
EFTUD2Q15029 TOE1-202ENST00000460057 592 ntTSL 38.96□□□□□ -0.983e-13■■■■■ 88
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EFTUD2Q15029 PGF-205ENST00000555253 3549 ntTSL 214.57□□□□□ -0.088e-12■■■■■ 86.3
EFTUD2Q15029 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.163e-24■■■■■ 86.3
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EFTUD2Q15029 CFH-205ENST00000496761 550 ntTSL 23.03□□□□□ -1.923e-10■■■■■ 85.6
EFTUD2Q15029 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.993e-10■■■■■ 85.6
EFTUD2Q15029 NDRG2-244ENST00000555650 1588 ntTSL 216.51■□□□□ 0.232e-16■■■■■ 85.3
EFTUD2Q15029 RPL35-203ENST00000487431 785 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.776e-10■■■■■ 84.6
EFTUD2Q15029 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.136e-10■■■■■ 84.6
EFTUD2Q15029 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.136e-10■■■■■ 84.6
EFTUD2Q15029 RPL35-204ENST00000493018 692 ntTSL 313.46□□□□□ -0.256e-10■■■■■ 84.6
EFTUD2Q15029 RPL35-202ENST00000373570 493 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.966e-10■■■■■ 84.6
EFTUD2Q15029 GRAMD1A-210ENST00000599476 599 ntTSL 28.17□□□□□ -1.19e-21■■■■■ 84.4
EFTUD2Q15029 SLC3A2-207ENST00000535768 597 ntTSL 59.59□□□□□ -0.872e-14■■■■■ 83.9
EFTUD2Q15029 TTC39B-204ENST00000505732 1881 ntTSL 1 (best)21.66■■□□□ 1.063e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 GAS8-208ENST00000564789 810 ntTSL 218.52■□□□□ 0.563e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.533e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.33e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.283e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 BAG6-260ENST00000465348 639 ntTSL 216.69■□□□□ 0.263e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-210ENST00000507746 950 ntTSL 515.78■□□□□ 0.123e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.083e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.073e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.123e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.133e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.263e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-207ENST00000549759 559 ntTSL 312.4□□□□□ -0.423e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 ATG16L1-213ENST00000473865 805 ntTSL 212.35□□□□□ -0.433e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 ZC3H15-206ENST00000477672 304 ntTSL 312.07□□□□□ -0.483e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-204ENST00000547130 559 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 TTC39B-205ENST00000506891 900 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.583e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-213ENST00000518126 830 ntTSL 211.44□□□□□ -0.583e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 PFDN5-216ENST00000552341 1980 ntTSL 211.12□□□□□ -0.633e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-209ENST00000506579 3482 ntTSL 211□□□□□ -0.653e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 ZC3H15-203ENST00000437396 556 ntTSL 410.77□□□□□ -0.693e-12■■■■■ 83.7
EFTUD2Q15029 HARS-206ENST00000502888 631 ntTSL 210.57□□□□□ -0.723e-12■■■■■ 83.7
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