Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GOLGA4Q13439 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GOLGA4Q13439 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GOLGA4Q13439 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GOLGA4Q13439 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GOLGA4Q13439 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA4Q13439 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLGA4Q13439 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLGA4Q13439 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLGA4Q13439 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA4Q13439 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLGA4Q13439 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA4Q13439 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLGA4Q13439 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA4Q13439 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA4Q13439 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GOLGA4Q13439 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GOLGA4Q13439 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GOLGA4Q13439 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GOLGA4Q13439 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GOLGA4Q13439 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GOLGA4Q13439 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA4Q13439 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA4Q13439 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA4Q13439 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA4Q13439 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA4Q13439 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA4Q13439 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA4Q13439 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA4Q13439 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GOLGA4Q13439 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA4Q13439 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA4Q13439 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA4Q13439 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA4Q13439 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GOLGA4Q13439 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA4Q13439 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GOLGA4Q13439 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA4Q13439 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA4Q13439 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA4Q13439 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA4Q13439 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA4Q13439 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA4Q13439 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA4Q13439 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA4Q13439 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA4Q13439 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA4Q13439 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GOLGA4Q13439 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA4Q13439 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GOLGA4Q13439 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA4Q13439 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA4Q13439 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA4Q13439 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA4Q13439 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA4Q13439 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA4Q13439 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA4Q13439 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA4Q13439 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA4Q13439 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA4Q13439 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA4Q13439 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA4Q13439 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA4Q13439 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA4Q13439 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
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